如前所述，尽管政策利好使得实体书店发展环境有所好转，但调研情况显示，实体书店要取得更好的发展仍然阻力重重，其困境和问题主要表现在以下四个方面。

　　（一） 实体书店购书群体持续缩减

　　实体书店普遍反映进店购书群体较十年前有大幅度的下降。据北京图书大厦反映，在客流中，有70%的顾客是只看不买的。分析原因主要有二：一是数字阅读的冲击。便携式电子产品的繁荣，尤其对购书群体造成了分流，影响了纸质书籍的销售。碎片化阅读、“浅阅读”逐渐占据了阅读纸质书籍的时间，对专业资料的获取也由原来的专业书刊向电子资料转移。消费者阅读习惯的改变，加上出版物数字化的发展趋势，使得实体书店原有的购书群体大幅缩减。二是网络书店低价倾销侵蚀实体书店利益。在电子商务日趋发达的今天，人们的购书习惯也发生了巨大变化，网络购书已经成为人们购书的重要消费方式。据统计，全国网上售书已占全部图书销售的30%左右。在被调查的实体书店中，九成以上认为网络书店的低价销售是对实体书店经营形成冲击的主要因素。在与上游出版企业议价过程中，网上书店比实体书店具有明显优势，因此能够以低折扣甚于低于成本价销售，抢夺市场占有率，对实体书店的销售产生了较大的挤占效应。很多实体书店往往沦为网上书店的“体验店”。

　　（二）实体书店经营成本上涨压力得不到有效缓解

　　不断上涨的房租和员工工资被认为是加速实体书店凋零的两大重要因素。近几年各地房租、人力成本持续上涨，尤其是一线城市的民营实体书店尤为明显。在被调查的民营书店中，书店租金占经营成本比重最高，大城市的店面租金成本普遍占到成本的30%～40%，有的甚至更高，且仍在逐年上涨。因无法支付房租，许多实体书店不得不向偏远地区或向“二楼”迁移。人力资本急增，有专业背景或工作经验的店员薪酬逐年上涨，也相应增加了经营成本。减免增值税等优惠政策所带来的利润很容易被不断上涨的房屋租金和员工工资所抵消。

　　（三）盗版屡禁不止，冲击实体书店

　　盗版书一直是实体书店的一个重大困扰，通过对多个城市的实体书店调研发现，绝大多数实体书店的所有者和管理者对盗版书等问题深恶痛绝，把盗版书问题视为当前实体书店经营困难的重要原因之一。盗版书等非法出版物一方面影响了正规出版物的销售，成本上的极大优势使得个别实体书店铤而走险，在正规书店中夹杂盗版书销售；另一方面，盗版图书屡禁不绝，造成“劣币驱逐良币”的现象，盗版图书将正版图书挤出市场，造成坚持诚信经营的实体书店经营丧失信心。

　　（四）实体书店自身观念陈旧或经营不善

　　抛开以上外因，一些书店自身也存在着严重的经营问题。主要表现在：一是书店经营者观念保守，不研究读者需求，产品雷同性较高，缺乏创新和特色。二是功能单一，缺少应有的文化活力和吸引力，阅读氛围不足，留不住读者。三是营销观念落伍，不能利用一些新的技术手段做宣传推广和便捷支付，与时代相脱节。四是服务意识不强，有的书店为降低成本，缺少必要的员工培训，造成服务不够专业，影响了顾客的购物体验，备受诟病。五是个别实体书店扩张速度过快，管理服务跟不上，等等。随着人民群众生活水平、消费水平的普遍提高，读者对书店有了新的期盼，特色化、个性化、精品化、便捷化、舒适化是新一代读者对书店的理想要求。要想把读者留住，就必须认真研究市场，研究读者需求，研究经营管理，不断改善优化服务。