他的《中国哲学史》是继胡适《中国哲学史大纲》之后又一部具有广泛影响的中国哲学史著作，代表了30年代中国哲学史研究的最高水平。此书被冯的美国学生卜德译成英文，成为现今西方人系统了解中国哲学的为数不多的著作之一。在这部巨著中，他自称为“释古派”而与胡适的“疑古派”相区别。

　　该书将中国哲学史分成子学时代与经学时代，以此全书分为上下册。子学时代主要讲先秦诸子，经学时代主要是从董仲舒到康有为、谭嗣同的时代。它是第一部完整的、具有现代意义的中国哲学史著述，它采用西方哲学的形式，阐释中国哲学思想之实，使中国传统哲学成为现代学科。该书的基本框架为中国哲学史界普遍接受，许多观点亦成为学术界的定论。韩国总统朴槿惠表示该书让自己找回内心的平静。

　　自序一

　　自序二

　　自序三

　　第一篇 子学时代

　　第一章 绪论

　　第二章 泛论子学时代

　　第三章 孔子以前及其同时之宗教的哲学的思想

　　第四章 孔子及儒家之初起

　　第五章 墨子及前期墨家

　　第六章 孟子及儒家中之孟学

　　第七章 战国时之百家之学

　　第八章 《老子》及道家中之《老》学

　　第九章 惠施、公孙龙及其他辩者

　　第十章 庄子及道家中之庄学

　　第十一章 《墨经》及后斯墨家

　　第十二章 荀子及儒家中之荀学

　　第十三章 韩非及其他法家

　　第十四章 秦汉之际之儒家

　　第十五章 《易传》及《淮南鸿烈》中之宇宙论

　　第十六章 儒家之六艺论及儒家之独尊

　　第二篇 经学时代

　　第一章 泛论经学时代

　　第二章 董仲舒与今文经学

　　第三章 两汉之际谶纬及象数之学

　　第四章 古文经学与扬雄、王充

　　第五章 南北朝之玄学（上）

　　第六章 南北朝之玄学（下）

　　第七章 南北朝之佛学及当时人对于佛学之争论

　　第八章 隋唐之佛学（上）

　　第九章 隋唐之佛学（下）

　　第十章 道学之初兴及道学中二氏之成分

　　第十一章 周濂溪、邵康节

　　第十二章 张横渠及二程

　　第十三章 朱子

　　第十四章 陆象山、王阳明及明代之心学

　　第十五章 清代道学之继续

　　第十六章 清代之今文经学

　　附录

　　原儒墨

　　原儒墨补

　　原名法阴阳道德

　　原杂家（与张可君合作）

　　孟子浩然之气章解

　　审查报告一（陈寅恪）

　　审查报告二（金岳霖）

　　审查报告三（陈寅恪）

　　校勘后记（蔡仲德）