作为著名的教育家、思想家，嵇文甫在哲学、史学等方面著述甚丰，其对船山学研究也作出了许多开创性贡献。嵇文甫在十七八岁时即接触船山著述，并终生受其影响。1935年就写成了《船山哲学》一书，晚年将其船山学研究成果汇成《王船山学术论丛》和《王船山史论选评》两部著作，对船山学提出了很多富有创见的真知灼论，在船山学研究方面具有里程碑意义。

　　船山学术谱系之探源

　　嵇文甫在王船山博大精深、自成体系的思想框架内，努力寻绎其学术渊源和谱系所在。对于王船山的学术谱系，嵇文甫认为，王学是继承张载之学。这点，船山本人也曾在其自撰墓志铭中写道：“希张横渠之正学而力不能企。”王夫之曾专门为张载的《正蒙》一书著有《张子正蒙注》，其序言中写道：“张子之学，上承孔孟之志，下救来兹之失，如皎日丽天，无幽不烛，圣人复起，未有能易焉者也。”嵇文甫不仅明确指出船山学术以张载为宗的特点，而且还注意探究王夫之与程朱、陆王的学脉关系。对于王夫之学术谱系产生的基础，嵇文甫深入到王夫之所处的时代背景中，去深究王夫之之所以摒弃程朱和陆王，而“别从横渠方面挖掘坠绪，以开自己一条道路”的社会思想根源。王夫之所处的时代正是明末清初之际，曾盛极一时的阳明心学已出现衰变和歧出，如颜山农、何心隐、李卓吾的“狂禅”之风。对于王学异端李贽等人，王夫之是敌视和否定的，将其斥为洪水猛兽。据此，从学术谱系上，嵇文甫总结王船山之学是“宗师横渠，修正程朱，反对陆王”。

　　此外，嵇文甫还注意挖掘王夫之与佛家、先秦诸子的思想渊源，并指出王夫之思想中的实证和唯物精神是深受晚明考据之风和质测之学的影响。在他看来，王夫之所著经传“稗疏”多见名物训诂等考据工夫，其实是受了方以智的考证风格影响。进而，嵇文甫认为王夫之因此而受些科学空气的熏陶，接触些新东西，并认为这些都是使王夫之从唯心主义转向唯物主义的重要因素。