港珠澳大桥可通行车辆包括：跨境巴士、穿梭巴士、跨境出租车、货运车辆、跨境私家车等。

　　——跨境巴士：大桥开通首年安排粤港、港澳跨境巴士配额共200个，其中粤港150个（供粤港合资公司）、港澳50个 (34个为香港配额，16个为澳门配额)，已全数发放(注：珠澳口岸间不通客车)。

　　——穿梭巴士：口岸穿梭巴士为大桥粤港及港澳口岸之间的主要交通工具，提供频密接驳服务。

　　——跨境出租车：大桥开通首3年安排粤港、港澳跨境出租车配额共250个。其中，粤港配额150个，港澳配额100个。

　　——货运车辆：在粤港跨境货车方面，现时粤港跨境货车可以免办手续通过港珠澳大桥（但不包括往来福田保税区的货车）。

　　——跨境私家车：在粤港私家车方面，在大桥开通前发出的香港两地牌私家车及内地私家车配额分别为约10000个和约1000个。此外，粤港政府也会在稍后适当时间宣布允许目前持有配额使用其他口岸的粤港两地牌跨境私家车，免手续试用大桥的细节安排。

　　大桥主体工程采用内地右侧通行规则，司机抵达或离开香港或澳门口岸后，可根据行车指示牌，按照标志行驶调整行车方式，车辆可完成左右侧交通转换；在非紧急情况下，车辆在大桥主桥及口岸均不允许掉头。

　　大桥主体工程全线设计通行速度为100km/h，具体通行速度将根据通行情况、气候情况、交通事故处理、交通控制等因素进行调控。就大车而言，有关车辆在大桥主桥行驶时须使用慢线，车速限制为80km/h。

　　港珠澳大桥全线设置1处主线收费站，双向共有20条收费车道。

　　7座以下私家车、出租车收费标准150元每车次；过境巴士200元每车次；穿梭巴士300元每车次；普通货车60元每车次；货柜车115元每车次。